Mae dau fath o ficrosgopau fflworoleuedd o ran eu llwybrau optegol:
1. Microsgop fflworoleuedd trawsyrru: Defnyddir y ffynhonnell golau excitation i gyffroi fflworoleuedd trwy basio trwy'r deunydd sbesimen trwy lens cyddwysydd. Gellir defnyddio crynodyddion maes tywyll a ddefnyddir yn gyffredin hefyd, a gellir defnyddio crynodyddion cyffredin i addasu'r adlewyrchydd i ailgyfeirio ac ochri'r golau cyffro ar y sbesimen. Mae hwn yn ficrosgop fflworoleuedd cymharol hen ffasiwn. Ei fantais yw fflworoleuedd cryf ar chwyddhad isel, ond ei anfantais yw bod ei fflworoleuedd yn lleihau gyda chwyddiad cynyddol. Felly, mae'n well arsylwi deunyddiau sbesimen mwy.
2. Mae microsgop fflworoleuedd golau cwympo yn fath newydd o ficrosgop fflworoleuedd a ddatblygwyd yn y cyfnod modern. Yn wahanol i'r uchod, mae'r golau cyffro yn disgyn o'r lens gwrthrychol i lawr i wyneb y sbesimen, gan ddefnyddio'r un lens gwrthrychol â'r cyddwysydd goleuo a'r lens gwrthrychol ar gyfer casglu fflworoleuedd. Mae angen ychwanegu holltwr trawst lliw deuol at y llwybr optegol, sydd 45 gradd ar wahân i'r wraniwm ysgafn. Ongl, mae'r golau excitation yn cael ei adlewyrchu yn y lens gwrthrychol ac yn canolbwyntio ar y sampl. Mae'r fflworoleuedd a gynhyrchir gan y sampl, yn ogystal â'r golau excitation a adlewyrchir o wyneb y lens gwrthrychol a'r gwydr gorchudd, yn mynd i mewn i'r lens gwrthrychol ac yn dychwelyd i'r holltwr trawst lliw deuol, gan wahanu'r golau cyffro a fflworoleuedd. Yna mae'r golau excitation gweddilliol yn cael ei amsugno gan yr hidlydd blocio. Os defnyddir gwahanol gyfuniadau o hidlyddion cyffro/gwahanwyr trawst lliw deuol/hidlwyr blocio, gallant ddiwallu anghenion gwahanol gynhyrchion adwaith fflwroleuol. Manteision y microsgop fflworoleuedd hwn yw goleuo maes unffurf, delweddu clir, a fflworoleuedd cryfach gyda chwyddhad mwy.
